1966年04月「佛教克难慈济功德会」在花莲县新城乡成立，开始慈善济贫的工作。
1972年09月「慈济贫民施医义诊所」在花莲市仁爱街开设。
1972年11月 首度下乡巡回义诊施药，于花莲县展开。
1979年05月 证严上人于慈济委员联谊会上发起筹建「佛教慈济医院」。

1980年01月 为兴办医院，向省府申请「财团法人佛教慈济慈善事业基金会」获立案通过。
1980年10月 省府林洋港主席首度莅临精舍参访，为胶着的建院用地带来曙光。
1980年10月 蒋总统经国先生莅临精舍，指示花莲县府设法协助建院用地问题。
1981年09月 「佛教慈济综合医院筹建委员会」正式成立。
1981年09月 修观法师脱售祖产捐款百万，为第一位响应建院护持百万的佛门大德。
1983年02月 慈院第一次动土典礼，于国富里建地举行，由省府主席李登辉主持。
1983年11月 在台北空军官兵活动中心举办第一次建院义卖。
1984年03月 佛教慈济综合医院董事会在台北菩提讲堂正式成立。
1984年04月 慈院第二次动土在新生南路举行，由印顺导师与内政部林洋港部长联合主持。

1985年05月 证严上人正式礼聘杜诗绵、曾文宾教授为慈院正、副院长。
1986年08月 慈济医院开业义诊，完成东部首例人工髋关节置换。
1986年08月 「佛教慈济综合医院」落成启业，秉持救人为先的理念，不收住院保证金。
1986年12月慈济医院成立「志工服务队」，同时展开第一期职前训练。
1988年01月 卫生署评鉴慈济医院为「准区域医院」。
1989年02月 慈济医院完成首例开心手术。
1989年06月 「慈济医学」双月刊创刊。
1989年07月 慈济医院杜诗绵院长因肝癌病逝，副院长曾文宾继任为院长。

1990年07月 慈济医院进行东部首例「器官捐赠移植手术」（眼角膜）。
1990年10月 慈济医院首开东部纪录，以「显微移植术」切除口腔癌。
1991年01月 「体外震波碎石机」启用，提升东部医疗水准，让病患免于手术之苦痛。
1991年06月 慈济医院东部首例「新生儿食道前端闭锁合并气管食道管手术」成功。
1991年06月 慈济医院「腹腔镜胆囊切除手术」成功，首开东部创举。
1991年07月 慈济医院完成东部首例免开刀的狭心症「经皮冠状动脉扩张术」。
1991年09月 医疗与慈善结合，慈济医院展开贫户医疗保健居家服务。
1992年01月 慈济医院「慈济医学研究中心」启用，以培养医学院师资及医疗网人才。
1992年10月 慈济医院开办东部首座「优生保健谘询中心」。
1993年10月 「慈济骨髓捐赠资料中心」成立，推广「救人一命，无损己身」的观念。
1993年12月 美国佛教慈济义诊中心在洛杉矶成立，是全美第一个佛教义诊机构。
1994年01月 慈济医院成立东部第一座「烫伤中心」。
1994年05月 慈济医院「东部地区空中急难专用停机坪」正式启用。
1994年09月 台湾首例跨国捐髓，送往新加坡中央医院移植。
1995年04月 菲律宾联络处与中华崇仁医院首次下乡义诊，照护贫病民众。
1995年05月 「骨髓捐赠相见欢」，台湾首例非亲属捐髓、受髓者会面
1995年06月 慈济医院陈英和医师完成高难度脊椎手术，矫正160度严重驼背。

1996年02月 「慈济骨髓捐赠资料中心」获第六届团体医疗奉献奖。
1996年05月 慈济医院启用东部第一座「腹膜透析室」，造福洗肾病友。
1996年06月 巴西联络处医疗中心开幕，以牙科义诊为主。
1996年08月 慈济医院启用「心莲病房」，推展安宁照护。
1996年10月 嘉义大林慈济医院动土开工。
1996年10月 加拿大慈济传统医学中心开幕。
1996年10月 成立「慈济医事人员联谊会」。
1997年03月 慈济医院骨骼银行接受第一例骨骼捐赠。
1997年08月 马来西亚槟城「佛教慈济洗肾中心」成立。
1998年01月「慈济医事人员联谊会」更名为「慈济人医会」
1998年01月 慈济医院「儿童发展复健中心」启用。
1998年06月 慈济医院老人日间照顾暨护理之家「轻安居」开幕。
1998年09月 慈济医院「身心康复病房」启用。
1999年01月 慈济医院完成东部首例「肝脏移植手术」。
1999年03月 花莲玉里慈济医院启业。
1999年07月 花莲慈济医院曾文宾院长功成身退，受聘为荣誉院长，由副院长陈英和接任院长。
1999年09月 九二一地震当天，慈济医院医疗团赶赴灾区抢救生命。

2000年03月 慈济医院「病毒性感染症检验实验室」挂牌成立。
2000年03月 台东县关山慈济医院启用。
2000年05月 美国夏威夷慈济义诊中心成立
2000年06月 台北「新店慈济医院」举行动土典礼。
2000年07月 美国慈济义诊中心「大爱医疗巡回车」启用。
2000年08月 大林慈济医院正式落成启用。
2000年08月 花莲慈济医院启用「PACS医疗影像数位化系统」，创造「无片化」环保医疗环境。
2000年11月 大林慈济医院「心莲病房」正式启用。
2000年11月 澳洲玛特医院设立「慈济爱心室」，向十年服务不懈的慈济志工致意。
2001年02月 花莲慈济医院心莲病房荣获行政院卫生署评为A级安宁缓和病房。
2001年04月 花莲慈济医院成立「儿科超音波检查室」，东部唯一全功能婴幼儿超音波配备。
2001年04月 花莲慈济医院「毒药物谘询中心」成立。
2001年11月 花莲慈济医院与卫生署合作远距医疗计画「活动医院」上路，服务偏远地区民众。

2002年01月 花莲玉里慈济医院新大楼动工。
2002年03月 马来西亚吉打州日得拉「佛教慈济洗肾中心」成立。
2002年03月 花莲慈济医院完成东部首例「骨髓移植手术」。
2002年04月 大林慈济医院成立云嘉地区第一所「医学研究部」。
2002年04月 慈济骨髓捐赠中心改制为「慈济骨髓干细胞中心」。
2002年05月 花莲慈济医院成立「癌症医学中心」。
2002年05月 马来西亚马六甲慈济义诊中心开幕。
2002年05月 花莲慈济医院完成首例「脑部血管绕道手术」。
2002年05月 花莲慈济医院发现恙虫病新病种：全球基因银行注册「 台湾本土第一株 」。
2002年07月 花莲慈济医院第三任院长陈英和荣退，副院长林欣荣继任为第四任院长。
2002年07月 花莲慈济医院获卫生署评鉴通过，成为东部第一家医学中心。
2002年07月 花莲慈济医院荣获疾病管制局颁发91年度「防疫有功医疗服务奖」。
2002年07月 花莲慈济医院首例「钥匙孔手术」，将血管瘤夹除。
2002年08月 花莲慈济医院「排尿障碍治疗中心」率先使用肉毒杆菌素注射治疗排尿障碍患者。
2002年08月 大林慈济医院成立「肝病防治中心」。
2002年09月 大林慈济医院「大埔医疗站」揭碑启用。
2002年09月 花莲慈济医院引进「微创手术」，肝脏血管分流、脑血管瘤栓塞免动大刀。
2002年09月 大林慈济医院成立「头颈部肿瘤治疗小组」，提供患者整合医疗服务。
2002年10月 花莲慈济医院成立「巴金森氏症研究中心」。
2002年11月 花莲慈济医院骨科主任于载九研发的「联髋二号人工髋关节系统」，
　　　　　 获得第一届国际生医新创奖。
2002年11月 花莲慈济医院获颁经济部「节约能源杰出奖」。
2002年11月 马来西亚北海「佛教慈济洗肾中心」成立。
2002年12月 花莲慈济医院成立「脑中风防治研究中心」。
2002年12月 花莲慈济医院首例「成人周边血干细胞移植」患者，顺利出院。

2003年01月 ◎大林慈济医院成立「呼吸照护中心」，
　　　　　　 针对呼吸衰竭、依赖呼吸器之患者提供呼吸照顾。
2003年03月 ◎大林慈济医院的巡回医疗车「大爱行动医生馆」正式上路，
　　　　　　 让预防保健的观念更深植民心。
2003年03月 ◎大林慈济医院完成第一例「骨髓移植抽髓手术」，
　　　　　　 这也是慈济骨髓干细胞中心第五百四十例非亲属骨髓捐赠。
2003年03月 ◎花莲慈济医院「癫痫治疗与研究中心」正式成立。
2003年05月 ◎卫生署在花莲慈济医院成立「东部SARS防疫指挥中心」，
　　　　　　 王立信副院长担任总召集人。
2003年05月 ◎大林慈济医院成立「发烧、咳嗽特别门诊」，
　　　　　　 防范院内SARS感染、落实发烧筛检。
2003年06月 ◎花莲慈济医院配合健保局推行「偏远地区及无中医乡巡回医疗服务试办计画」。
　　　　　◎卫生署在花莲慈济医院建立「SARS病毒检验合约实验室」。
2003年06月 ◎国际病毒研究权威C.J.Peters来花莲慈济医院演讲、座谈，并提供美国防疫经验。
2003年06月 ◎花莲慈济医院完成首例「连体婴分割手术」。
2003年07月 ◎花莲慈济医院启用「合心基因发展中心」及「正子中心」。
2003年08月 ◎马来西亚巴生慈济义诊中心启用。
2003年08月 ◎印尼慈济大爱村「义诊中心」启用
2003年10月 ◎大林慈济医院「斗六门诊部」启业。
2003年10月 ◎花莲玉里慈济医院新大楼正式启用。